永康市疾病预防控制中心于2002年在原永康市卫生防疫站的基础上组建而成，为人民群众提供疾病预防控制服务和卫生监督保障。主要承担疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情及健康相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、健康教育与健康促进、卫生检验检测与评价、疾病预防控制技术管理与应用研究指导、卫生监督相关行政辅助和技术保障工作等职能。

疾控中心编制数为99人，设办公室、综合保障科、法制稽查科、质量技术管理科、传染病预防控制科、艾滋病结核病防治科、慢性非传染性疾病防治科、营养与食品安全科、环境与职业卫生科、检验科、健康教育科、医疗卫生监督科、公共卫生监督科、职业卫生监督科14个科室。